MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Repeats of Borrelia afzelii PKo plasmid cp32-1

Total Repeats: 761

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1	NC_017230	TAT	2	6	30	35	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
2	NC_017230	AC	3	6	36	41	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
3	NC_017230	TAA	2	6	46	51	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
4	NC_017230	A	6	6	60	65	100 %	0 %	0 %	0 %	384206221
5	NC_017230	TG	3	6	66	71	0 %	50 %	50 %	0 %	384206221
6	NC_017230	TA	3	6	117	122	50 %	50 %	0 %	0 %	384206221
7	NC_017230	T	6	6	134	139	0 %	100 %	0 %	0 %	384206221
8	NC_017230	AGA	2	6	163	168	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	384206221
9	NC_017230	TAT	2	6	271	276	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	384206221
10	NC_017230	ACT	2	6	328	333	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	384206221
11	NC_017230	TTGATT	2	12	414	425	16.67 %	66.67 %	16.67 %	0 %	384206221
12	NC_017230	TAA	3	9	448	456	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	384206221
13	NC_017230	ATA	2	6	500	505	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	384206221
14	NC_017230	T	6	6	559	564	0 %	100 %	0 %	0 %	384206221
15	NC_017230	A	6	6	585	590	100 %	0 %	0 %	0 %	384206221
16	NC_017230	T	6	6	628	633	0 %	100 %	0 %	0 %	384206221
17	NC_017230	CAA	2	6	684	689	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	384206221
18	NC_017230	CTT	2	6	690	695	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	384206221
19	NC_017230	AGT	2	6	716	721	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	384206221
20	NC_017230	TAA	2	6	853	858	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	384206221
21	NC_017230	TTA	2	6	903	908	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	384206221
22	NC_017230	ATTA	2	8	943	950	50 %	50 %	0 %	0 %	384206221
23	NC_017230	ATG	2	6	1023	1028	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	384206221
24	NC_017230	ATT	2	6	1047	1052	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	384206221
25	NC_017230	AGTA	2	8	1109	1116	50 %	25 %	25 %	0 %	384206221
26	NC_017230	AGTA	2	8	1205	1212	50 %	25 %	25 %	0 %	384206221
27	NC_017230	TAA	2	6	1240	1245	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	384206221
28	NC_017230	GAG	2	6	1247	1252	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	384206221
29	NC_017230	ATT	2	6	1273	1278	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	384206221
30	NC_017230	GAA	2	6	1317	1322	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	384206222
31	NC_017230	AAG	2	6	1324	1329	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	384206222
32	NC_017230	AGG	2	6	1348	1353	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	384206222
33	NC_017230	CAG	2	6	1356	1361	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	384206222
34	NC_017230	AG	4	8	1508	1515	50 %	0 %	50 %	0 %	384206222
35	NC_017230	AGC	2	6	1590	1595	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	384206222
36	NC_017230	TAA	2	6	1601	1606	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	384206222
37	NC_017230	A	6	6	1793	1798	100 %	0 %	0 %	0 %	384206222
38	NC_017230	TTC	3	9	1811	1819	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	384206222
39	NC_017230	ATT	2	6	1842	1847	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	384206222
40	NC_017230	AGA	2	6	1856	1861	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	384206222
41	NC_017230	AATT	2	8	1895	1902	50 %	50 %	0 %	0 %	384206222
42	NC_017230	AGA	2	6	2035	2040	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	384206223
43	NC_017230	A	6	6	2048	2053	100 %	0 %	0 %	0 %	384206223
44	NC_017230	CAA	2	6	2087	2092	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	384206223
45	NC_017230	TGG	2	6	2155	2160	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	384206223
46	NC_017230	AGC	2	6	2171	2176	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	384206223
47	NC_017230	TGG	3	9	2278	2286	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	384206223
48	NC_017230	TGA	2	6	2287	2292	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	384206223
49	NC_017230	ACT	2	6	2453	2458	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	384206223
50	NC_017230	AGA	2	6	2512	2517	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	384206223
51	NC_017230	TTAT	2	8	2519	2526	25 %	75 %	0 %	0 %	384206223
52	NC_017230	GTAA	2	8	2566	2573	50 %	25 %	25 %	0 %	384206223
53	NC_017230	GTT	2	6	2601	2606	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	384206224
54	NC_017230	GCAG	2	8	2627	2634	25 %	0 %	50 %	25 %	384206224
55	NC_017230	GCT	2	6	2643	2648	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	384206224
56	NC_017230	CAAG	2	8	2664	2671	50 %	0 %	25 %	25 %	384206224
57	NC_017230	GAT	2	6	2727	2732	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	384206224
58	NC_017230	A	6	6	2748	2753	100 %	0 %	0 %	0 %	384206224
59	NC_017230	GTT	2	6	2806	2811	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	384206224
60	NC_017230	GAGC	2	8	2826	2833	25 %	0 %	50 %	25 %	384206224
61	NC_017230	A	6	6	2897	2902	100 %	0 %	0 %	0 %	384206224
62	NC_017230	TA	3	6	2951	2956	50 %	50 %	0 %	0 %	384206224
63	NC_017230	CTGATA	2	12	2971	2982	33.33 %	33.33 %	16.67 %	16.67 %	384206224
64	NC_017230	ATGT	2	8	3001	3008	25 %	50 %	25 %	0 %	384206224
65	NC_017230	TAA	2	6	3044	3049	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	384206224
66	NC_017230	ATAA	2	8	3108	3115	75 %	25 %	0 %	0 %	384206224
67	NC_017230	TTA	2	6	3124	3129	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	384206224
68	NC_017230	CT	3	6	3174	3179	0 %	50 %	0 %	50 %	384206224
69	NC_017230	CAAT	2	8	3190	3197	50 %	25 %	0 %	25 %	384206224
70	NC_017230	AGAT	2	8	3233	3240	50 %	25 %	25 %	0 %	384206224
71	NC_017230	ATT	2	6	3253	3258	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	384206224
72	NC_017230	TTAAT	2	10	3262	3271	40 %	60 %	0 %	0 %	384206224
73	NC_017230	ATA	2	6	3309	3314	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	384206224
74	NC_017230	TGG	2	6	3326	3331	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	384206224
75	NC_017230	AGG	2	6	3347	3352	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
76	NC_017230	AATG	2	8	3355	3362	50 %	25 %	25 %	0 %	384206225
77	NC_017230	T	6	6	3492	3497	0 %	100 %	0 %	0 %	384206225
78	NC_017230	G	6	6	3504	3509	0 %	0 %	100 %	0 %	384206225
79	NC_017230	ATC	2	6	3541	3546	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	384206225
80	NC_017230	TGG	2	6	3638	3643	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	384206225
81	NC_017230	AAT	2	6	3717	3722	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	384206225
82	NC_017230	TAG	2	6	3736	3741	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	384206225
83	NC_017230	GCA	2	6	3816	3821	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	384206225
84	NC_017230	GCAAA	2	10	3858	3867	60 %	0 %	20 %	20 %	384206225
85	NC_017230	ATG	2	6	3874	3879	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	384206225
86	NC_017230	GTAA	2	8	3918	3925	50 %	25 %	25 %	0 %	384206225
87	NC_017230	TAA	2	6	3930	3935	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	384206225
88	NC_017230	AGG	2	6	3941	3946	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
89	NC_017230	ATT	2	6	3959	3964	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	384206226
90	NC_017230	TGA	2	6	3965	3970	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	384206226
91	NC_017230	ATT	2	6	3973	3978	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	384206226
92	NC_017230	TAT	2	6	4022	4027	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	384206226
93	NC_017230	AGA	2	6	4055	4060	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	384206226
94	NC_017230	AGT	2	6	4178	4183	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	384206226
95	NC_017230	AT	3	6	4262	4267	50 %	50 %	0 %	0 %	384206226
96	NC_017230	TAA	3	9	4277	4285	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	384206226
97	NC_017230	ATT	2	6	4329	4334	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	384206226
98	NC_017230	TTA	2	6	4339	4344	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	384206226
99	NC_017230	A	6	6	4388	4393	100 %	0 %	0 %	0 %	384206226
100	NC_017230	ACT	2	6	4424	4429	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	384206226
101	NC_017230	AGA	2	6	4451	4456	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	384206226
102	NC_017230	GTG	2	6	4465	4470	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	384206226
103	NC_017230	A	6	6	4498	4503	100 %	0 %	0 %	0 %	384206226
104	NC_017230	ATG	2	6	4554	4559	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	384206226
105	NC_017230	CAG	2	6	4606	4611	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	384206226
106	NC_017230	GCA	2	6	4620	4625	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	384206226
107	NC_017230	TAA	2	6	4676	4681	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	384206226
108	NC_017230	TCAT	2	8	4832	4839	25 %	50 %	0 %	25 %	384206226
109	NC_017230	CTA	2	6	4870	4875	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	384206226
110	NC_017230	TAAAT	2	10	4924	4933	60 %	40 %	0 %	0 %	384206227
111	NC_017230	GAA	3	9	4971	4979	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	384206227
112	NC_017230	GTT	2	6	5184	5189	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	384206227
113	NC_017230	GAATTT	2	12	5193	5204	33.33 %	50 %	16.67 %	0 %	384206227
114	NC_017230	A	6	6	5214	5219	100 %	0 %	0 %	0 %	384206227
115	NC_017230	ATT	2	6	5245	5250	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	384206227
116	NC_017230	TAGTGG	2	12	5255	5266	16.67 %	33.33 %	50 %	0 %	384206227
117	NC_017230	AG	3	6	5273	5278	50 %	0 %	50 %	0 %	384206227
118	NC_017230	AG	3	6	5349	5354	50 %	0 %	50 %	0 %	384206227
119	NC_017230	AGTG	2	8	5386	5393	25 %	25 %	50 %	0 %	384206227
120	NC_017230	TGT	2	6	5479	5484	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	384206228
121	NC_017230	GAC	2	6	5498	5503	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	384206228
122	NC_017230	AGTA	2	8	5528	5535	50 %	25 %	25 %	0 %	384206228
123	NC_017230	TTA	2	6	5553	5558	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	384206228
124	NC_017230	AT	3	6	5601	5606	50 %	50 %	0 %	0 %	384206228
125	NC_017230	ATACT	2	10	5728	5737	40 %	40 %	0 %	20 %	384206228
126	NC_017230	GGAC	2	8	5760	5767	25 %	0 %	50 %	25 %	384206228
127	NC_017230	TTGG	2	8	5792	5799	0 %	50 %	50 %	0 %	384206229
128	NC_017230	GGC	2	6	5839	5844	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	384206229
129	NC_017230	AT	3	6	5904	5909	50 %	50 %	0 %	0 %	384206229
130	NC_017230	CAA	2	6	5910	5915	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	384206229
131	NC_017230	TA	3	6	5920	5925	50 %	50 %	0 %	0 %	384206229
132	NC_017230	ATGC	2	8	5959	5966	25 %	25 %	25 %	25 %	384206229
133	NC_017230	A	6	6	6061	6066	100 %	0 %	0 %	0 %	384206229
134	NC_017230	GTA	2	6	6068	6073	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	384206229
135	NC_017230	TTG	2	6	6092	6097	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	384206229
136	NC_017230	AACT	2	8	6119	6126	50 %	25 %	0 %	25 %	384206229
137	NC_017230	AAT	2	6	6216	6221	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	384206230
138	NC_017230	ATC	2	6	6250	6255	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	384206230
139	NC_017230	ACT	2	6	6276	6281	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	384206230
140	NC_017230	TAATA	2	10	6287	6296	60 %	40 %	0 %	0 %	384206230
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256	NC_017230	ATATT	2	10	11598	11607	40 %	60 %	0 %	0 %	384206237
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263	NC_017230	A	6	6	11896	11901	100 %	0 %	0 %	0 %	384206237
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268	NC_017230	A	6	6	12119	12124	100 %	0 %	0 %	0 %	384206238
269	NC_017230	TAC	2	6	12169	12174	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	384206238
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